在為病人進行異體骨髓移植之前，我們都會為病人及捐贈者進行HLA typing。何謂HLA呢？它的全名是human leukocyte antigen，是人體的進行自我識別一套系統。
HLA分class I及class II，class I包括HLA-A、HLA-B及HLA-C，class II包括HLA-DR、HLA-DQ及HLA-DP。Class I在身體的全部細胞上都有，class II則只在某些免疫細胞上可以找到。如果免疫系統偵測到某些細胞的HLA與自己身體的不相同，就會向它發動攻擊。
在一般的血科癌症中，如果是近親間的異體骨髓移植，需要4組HLA配對。如果是非近親間的異體骨髓移植，需要5組HLA配對。
如果HLA不配對，會有甚麼問題呢？一是病人的免疫系統會攻擊捐贈者的組織，影響到捐贈者組織的正常運作，這個問題在其他器官移植中很常見，但在骨髓移植中，它反而不是最大的問題。最大的問題是病人本身的免疫力很弱，捐贈者骨髓製造的免疫細胞可以反客為主，攻擊病人，引起發燒、肝功能衰退、皮膚出疹、肚瀉等症狀，嚴重的更可以致命，這個現象有一個很傳神的名稱，叫「移植物對抗宿主疾病」(Graft versus host disease）。
你可能會問，既然如此危險，為什麼不規定要所有HLA都完全配對才可以進行移植？一來HLA完全配對的機會很低，會大大增加為病人找到骨髓的難度。但除此之外，原來輕輕的不配對正是我們想要的效果，因為捐贈者骨髓製造的免疫細胞會因這個輕輕的不配對而攻擊病人的血癌細胞，變相是利用了「移植物對抗宿主」這個現象去治好血癌，這個現象稱為「移植物對抗白血病現象」（Graft versus leukaemia effect）。
