使用微波爐常令大家有很多的疑慮，第一個常見的問題是微波爐是否產生輻射線，第二個問題則是微波會否會破壞食物的安全和養分。對於使用微波爐加熱是否會產生輻射線，其實微波是電磁輻射的一種，但並非屬於游離輻射，因此不會像X光、伽瑪射線那樣對人體有基因毒性。
微波加熱的原理是藉由震動水、油、糖等等的分子產生高熱，因此它並沒有殘留輻射的可能性，也由於微波加熱是藉由震動食物內部分子，所以與盛裝容器也沒有太大的關係，因此使用微波爐加熱後可能會發現容器本身還是低溫的，但食物的溫度卻已非常的高，這中間就產生兩個問題。
第一個問題是如全雞這類較大型的食物，如果要靠微波來煮熟事實上是非常危險的，因為會有受熱不均勻，導致一部份已經熟了，另一部份卻仍是生的問題，可能會令食用者上吐下瀉的風險。第二個問題則是微波加熱可能會有突沸狀況，所以用微波來加熱飲用水，煮熟沒有剝殼或沒有刻意打破殼的蛋，甚至沒有削皮的馬鈴薯等都曾有報告發生突沸，而讓人臉嚴重燙傷的紀錄。
在微波對於養分的影響問題方面，我想到微波加熱蜂蜜的研究，由於蜂蜜中的糖是微波時最容易震盪的分子之一，所以它容易產生高熱，也因此使得當中會有醛類的產生，這對人體健康非常不好，因此我會建議用水加熱蜂蜜，以避免產生那麼多的有害醛類。
至於其他微波對於養分的影響目前看起來是有限的，並沒有太多證據說明它會造成大量的養分衰減，當然微波除了會造成一部分的養分衰減之外，也同時會造成一些毒物或是毒廢物的減少，我們發現食物經過微波加熱後，食物中的硝酸鹽會減少、它的植酸也會減少，也就是說使用微波可能會流失一小部分的養分，但同時有害物質也一併減少，因此我個人對於微波並沒有那麼大的反感或那麼多的擔心。
不過因為它不太適合較大型食物的加熱，所以我們家微波爐大多還是用來熱剩菜、熱一杯牛奶、或是用來退冰等簡單的加熱工作為主，不太會把東西從頭到尾在微波爐裡面加熱。
我認為使用微波爐最要小心的反而是另外兩個問題，第一個是洩波的狀況，第二個是低頻磁波的問題。
微波爐的門經過反覆的關開之後，它很容易產生洩波的問題，最危險的微波爐不是家裡的而是超商的微波爐，因為它一個中午可能會加熱一、兩百個便當，所以消費者基金會等團體的檢驗也發現超商的微波爐常會有洩波的問題，因此建議孕婦儘量不要靠近超商微波爐、或是不要眼睛盯著加熱的微波爐看，因為眼睛水晶體裡的水分子萬一被加熱，水晶體灼化就會變成白內障。
第二個問題是電磁波的問題，微波爐本身有低頻磁波的遮蔽，它屬於重電器，問題是它後面的散熱孔沒辦法保持遮蔽，所以高能量的低頻磁波可能就從散熱孔洩出去，也因此後面散熱孔所緊鄰的部分是必須注意的，即使是隔著牆壁，由於鋼筋混泥土沒辦法阻絕微波，所以微波爐貼著牆，牆的另一邊若擺著床，躺在上面的人就會受到嚴重的低頻磁波影響。此外，我們發現老舊的微波爐即使沒有啟動，只要插上電源就會有洩波的現象。
最後，要叮嚀消費者微波爐是個重電器，使用一次消耗可達1000多瓦，而一般家庭的迴路，一個迴路能承受的就是15安培的電流，所以使用微波爐時再加上任何電器就容易造成跳電的風險，反覆的跳電就容易引起電線火災，所以建議廚房最好擁有兩套迴路。如果你現在使用的微波爐，同時併用其他電鍋、烤箱等電器常會一起跳電的話，請你記得要來審視一下用電安全，並思考是否可能要加裝其他迴路。
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