基因體重新排列組合是眾多癌症的關鍵特徵之一,它能加快突變的癌細胞生長,且幫助其產生抗藥性,使抗癌療法失效。
所有的癌症最初的開端都與基因🧬的各種錯誤有關,人體每天都有基因複製的出錯,但也有自我除錯修正的機制。然而一旦出錯大於除錯,日積月累下來小則是器官功能衰退(就是老化,例如皮膚的角化丶肉芽、斑塊增加⋯),大則成為癌症。
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染色體破碎幫助癌細胞基因體和 ecDAN 大規模重排
近日,加州大學聖地牙哥分校醫學院的研究團隊發現「染色體破碎」(chromothripsis)會導致癌細胞基因體和染色體外 DNA(extra-chromosomal DNA, ecDNA)的大規模重新排列,進而幫助突變的癌細胞不僅逃避治療,而且更具攻擊性。該研究刊登於《Nature》期刊。
該研究團隊發現,在發生染色體破碎的過程中,細胞中的一條染色體被破碎成許多碎片,而在某些情況下甚至會被分解成數百個碎片,然後以重新排列的順序重新組裝。有些片段丟失了,而另一些則保留為 ecDNA。
先前研究發現,在許多類型的癌症中,多達一半的癌細胞含有 ecDNA 這些致癌基因。他們發現,這些 ecDNA 的一些元素能促進癌細胞生長,並形成名為「雙微體」(double minutes)的微小染色體。
染色體破碎如何幫助癌細胞產生抗藥性?
首先,該研究團隊利用 Hi-C 染色體構象捕獲技術和全基因體定序來確定癌細胞基因擴增的步驟以及對化療藥物 methotrexate 抗藥性的機制。另外,他們還確定了染色體內基因擴增後,染色質去磷酸酶如何驅動 ecDNA 的形成。
染色體破碎在最初在低表現藥物選擇下形成染色體內擴增(內部),過程中,染色體持續「破裂-融合-搭橋」循環中,產生 1 兆鹼基(100 megabases)長度的擴增子,並被夾在間期搭橋中(interphase bridges),然後破碎,從而產生了微核,其微囊化的 ecDNAs 是染色質的底物,再透過多聚ADP 核醣聚合酶(Poly ADP-ribose polymerase, PARP)為細胞進行修復功能時的重要蛋白質和 DNA依賴蛋白激酶(DNA-dependent protein kinase, DNA-PKcs)的催化次單元轉換為染色體外(外部)擴增,然後擴增的 ecDNA 可以幫助那些因化療或放射療法而受損的癌細胞 DNA 重新整合到染色體位置。
未來應用
該研究不僅描繪出染色質增生在癌細胞中 DNA 生命週期的作用,更解釋了癌細胞如何變得更具侵略性或產生抗藥性。未來可以針對此路徑,去設計且開發新的藥物,來防止抗藥性的產生,進而改善癌症患者的存活率和生活品質。
參考資料:
1. Nature (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-03064-z
文章引述來源:
https://geneonline.news/index.php/2020/12/25/chromothripsis-drug-resistance/?fbclid=IwAR1yfZ32yGmU1OofBBa8R2UuS-1dgDWe5zdf9bLk-zCXptiiK4WXaDILYmc
全基因體定序 在 國家衛生研究院-論壇 Facebook 的最讚貼文
【亞太生醫矽谷精準醫療計畫成果展示暨學術研討會】
跨部會署科技計畫「亞太生醫矽谷精準醫療旗艦計畫」響應「5+2產業創新計畫」,以建構精準健康照護體系為主軸,執行至今,四年有成,亦於昨(23)日舉辦成果展示暨學術研討會。
活動由國家衛生研究院學術發展處處長暨計畫主持人蔡世峯主持,多位業界先進及嘉賓齊聚一堂,相互研究探討,長期支持計畫發展的國衛院院長梁賡義,以及前副總統、現任中央研究院院士陳建仁亦蒞臨致詞予以鼓勵。
蔡世峯處長表示,計畫執行至今,已完成逾5,000個案基因體定序(全基因體定序+全外顯子定序),為台灣目前最大的疾病基因體資訊;甚至,建立「台灣罕見疾病研究網」(TRDN),與中華民國人類遺傳學會及罕病基金會共同合作,利用該網絡之診斷確診率可高達70.3%,未來,亦將發展預防醫學,最重要的是以Public Private-Partnership(PPP)之模式,達成產業發展之長遠目標。
此次成果展示暨學術研討會,規劃六大主題包括:生技領航健康永續、國際鏈結展望未來、旗艦領航產業躍昇、研究轉譯研發提升、精準探索弱勢關懷、菁英訓練人才培育等領域。
蔡世峯處長說,旗艦計畫並未停頓,未來仍將持續探究,2021~2024年著手罕病難症之臨床服務及研究發展,訂定中長程發展策略藍圖,2027年之長程效益目標為成立三家衍生公司並帶動周邊聚落效應達200~600億之價值,期許2030年全民基因體檢測和全齡精準健康在國際合作方面能有更實質之雙邊合作。
【Reference】
圖說:前副總統、現任 中央研究院 Academia Sinica院士陳建仁(左三)、 財團法人國家衛生研究院院長梁賡義(左二)及計畫主持人蔡世峯處長等(右二)於「亞太生醫矽谷精準醫療旗艦計畫」成果展示暨學術研討會活動中合影。
1.資料/照片 來源:
中時新聞網 - 「亞太生醫矽谷精準醫療計畫 展成果」
https://www.chinatimes.com/newspapers/20201224000290-260206?chdtv
全基因體定序 在 高雄好過日 Facebook 的最讚貼文
【當中國病毒征服世界- 寂寞的先知台灣】
文:3Q 陳柏惟
「新型冠狀病毒來自美軍」、「中國拯救世界」、「學習中國防疫經驗」...... 這幾天,這些離譜的中國大外宣鋪天蓋地,不論是義大利乃至英美,都出現與之唱和的文章,大肆讚揚中國官方抗役有成,疫情數字快速下降,仿佛就如同中國所宣稱「全世界都要感謝中國」。
想也知道,不管世界信不信,正常的台灣人是不信的。
以下,我們就要帶大家回顧武漢肺炎的起源,告訴大家,這個國家如何透過謊言欺騙世界、助長病毒擴張、殘害全人類!
#官方封鎖消息下錯失早期防控良機
原本中國發表的資料中,第一起案例是在12月1日發病,這名個案,並沒有去過華南海鮮市場。但隨著被挖出的資訊越來越多,《南華早報》就報導,早在11月17日,就已有不明肺炎病例傳出。到1月1日,武漢當地可能病例數已達381例(但官方數字到1月11日仍只有41例),且早就有社區人傳人的明確跡象。若是資訊透明,任何一位受過訓練的醫師都能輕易看出疫情已接近失控。
12月27日,一位肺炎病人肺泡灌洗樣本檢測出爐,證實病原是一種新型冠狀病毒。這原本可以控制疫情的契機,但檢測的基因測序公司在將結果報告武漢市中心醫院與武漢衛生主管單位後,資訊一路上傳到中央衛健委。但接著該公司卻接到湖北省衛健委官員電話,通知該公司,禁止再驗、禁止透露相關訊息,已有樣本必須銷毀!
另一名病人的養本,則送到了北京另一家檢驗公司,當報告送回時,中心醫院眼科醫師李文亮、紅會醫院神經內科醫師劉文、協和醫院腫瘤中心醫師謝琳卡等人,在私群組中透露「有一種類似SARS病毒」的訊息,要大家小心。而這幾位醫師都被警察盯上,遭到訓誡,官方並痛斥他們「散播謠言」。
#中國中央介入隱瞞疫情
也在同一時刻,中國各大平台開始審查與屏蔽與病毒相關的關鍵字,如「武漢不明肺炎」等等。
在官方爾後追溯的說法中,解出病毒序列的,則是中科院武漢病毒所,以及上海公共衛生臨床中心,分別在1月2日與1月5日完成全基因體定序,並在1月11日就上傳GISAID(全球共享流感數據倡議組織)上,向世界公布。
1月3日,國家衛健委辦公廳發布通知,要求嚴格管理樣本與相關資訊,最慢不晚於此時,中國高層已了解病情擴散及病原體類型的資訊。
1月7日,習近平主持中央政治局常委會會議時,自稱「#對新型冠狀病毒肺炎疫情防控工作提出了要求」。但在官方的文件裡,並沒有說明皇上的要求是什麼。
但只要比對中國官方實際做了什麼,我們就知道了,習近平的要求,大體不脫:「封鎖消息,全力維穩」,特別是1月11日就是台灣的大選之日,若疫情爆發,對中國不利。
因此,1月5日,中國官方表示「未發現人傳人證據」、1月14日再重申「未發現明確人傳人證據」,而WHO也照單全收告訴全世界放心。
#疫情悄悄傳向世界
1月6日武漢市兩會開幕,到1月10日閉幕。1月11日湖北省兩會開幕,到1月18日閉幕。在這段時間內,武漢市衛健委「零通報」,病例停滯在零星數十例,因此,武漢市各項活動照舊,包含1月19日舉辦「萬家宴」,春節疏運也早已開始。
1月13日,泰國出現首起病例,然而此時中國湖北省以外病例要到19日才出現,這樣明顯不合理的狀況,也被中國網友戲稱為「#愛國病毒」,英美流行病學家則直接發表論文,指稱以交通量估計,湖北已存在約至少2000例感染病例,是中國官方宣稱的50倍,在這個時間點,數百萬人已經離開武漢,將病毒擴散出去。
1月20日,習近平終於公開指出:「必須高度重視疫情,要求各級政府把人民群眾生命安全和身體健康放在第一位。」(這暗示,1月7日的指示中,放在第一位的顯然不是人民生命安全)在習近平態度確定後,湖北與其他各省通報案例開始快速增加,而中國官方也象徵性的透過鐘南山承認「人傳人」。
1月23日,在無預警下,武漢封城;之後的故事,大家應該比較清楚了。
#台灣不相信中國因此得救
相對於中國的粉絲太平,WHO的全力唱和。台灣對於這個「不明肺炎」的態度,從開始到現在,始終都不相信中國單方面的宣傳。
就是這點,造成了世界淪陷,而台灣至今相對安全的現狀。
早在12月31日,衛福部就嗅到了不尋常的氣味。針對中國「不明肺炎」疫情,台灣已經向WHO的IHR窗口示警病毒可能人傳人,同時開始實施登機檢疫。
1月2日,疾管署示警醫療院所提高警覺心,隔天並初步判斷是一種新型冠狀病毒感染;而在1月5日,疾管署就召開專家諮詢會議,來研商疫情如何發展。1月6日,我國去函中國表示有意派專家調查,並於1月13日實際前往中國了解狀況。
1月15日,武漢肺炎被列為第五類法定傳染病,當作會人傳人直接來進行防治。
1月20日,中央流行疫情中心3級開設。在這之前,行政院院會已經連續三次提到武漢肺炎疫情,選前選後蘇貞昌內閣都關心著疫情的變化。
而在武漢封城那天,台灣下達了禁止口罩出口,疫情中心2級開設,暫停湖北直航班機等數個決策,並逐漸設置防火牆阻擋與中國來往。
#中國從加害者變成拯救者
從11月底到12月中,不明肺炎在武漢小規模傳播,這時候對疫情與病源都尚無法掌握,並非不合理。
但在12月中病例開始跳升,病原體確定後,中央也很快接獲情報後,接下來,就完全是中國的問題了。我們沒有證據中國製造了病毒,但我們有明確的證據,中國官方蓄意造成了病毒的散播,並且蓄意欺瞞世界至少20天之久,透過WHO降低全世界的防疫決心,導致了世界大流行與社會經濟的恐慌。
在全世界都被病毒籠罩後,反正全世界都有案例了,甚至有些國家已經放棄輕症檢驗與疫調,中國這時候假造病例數字,其實也不會再被發現。此時,中國再跳出來散播關於病毒的假訊息,嘲笑西方國家的防疫措施,貶低台灣等國的防疫成就,提供世界「防疫知識」,在恐慌中,莫名其妙的就有許多人信了,而也正是在恐慌中,「相信黨,不害怕」的中國,就成了體質最強韌的國家。再一次的,這個病毒的起源國,卻成了最大贏家。
#世界必須正視台灣的重要
當失敗變成勝利,死亡變成希望,入侵的野心變成了和平的橄欖枝,伸進了每個相信中國的國家中,這是世界的悲劇,更是人類的悲劇。
更大的悲劇是,早有人不斷示警「不要相信中國」,但就像希臘神話的卡珊德拉,沒有人理會他的聲嘶力竭。
這個預言者,就是台灣。
世界能否抵抗中國的野心,免於極權暴政的侵略與奴役,關鍵其實就在於台灣。我們已經證明了,我們足夠瞭解中國,並且在天天被中國以複合戰進攻下,有一定的能力抵禦。這樣的消息,必須讓世界的更多人知道,也必須團結更多相信人類普世價值的國家,和我們站在同一陣線!