自己行為骯髒污穢不守法的吳茂昆，竟然說自己從來沒有做錯過事情了，然後指責管中閔的小瑕疵。如果管中閔所謂的違法兼職不可以擔任台大校長，吳茂昆更為明確的違法兼職還可以當教育部長嗎？
反了！都反了！這世界完全反了！小人得志，君子掩泣⋯⋯
https://udn.com/news/story/12012/3120823
明顯看出101年、102年、103年期間並未呈報經教育部許可。故而，教育部於104年9月7日函覆東華大學時表示「案內所報兼職，部分係屬自102年4月即已受聘，嗣後請確實依規定程序及時辦理報核程序」。
柯志恩表示，吳茂昆任校長時若非隱匿不報，就是未經核可就擔任董事多年，這樣的部長有何資格指控別人「偷跑」呢？
柯志恩指出，更奇怪的是，吳茂昆還以東華大學校長身分擔任「國立海洋科技博物館新建營運移轉（OT-BOT）案」的「協調委員」（104年8月10日至107年8月29日）。此興建工程即委託慶富集團的子公司--慶陽海洋企業，原本預計斥資15億元興建、興建經營海生館，並向土地銀行、高雄銀行等5間銀行聯貸9.5億元。或許因慶富挪用慶陽興建海生館的專款，導致工程嚴重落後，到預定開館日，現場只見地基，實際工程進度不到25％，最後慶陽違約跳票，本案失敗收場，也造成土銀損失將近5億，去年12月經監察院調查後，對土銀和海科館均提出糾正。
依「國立海洋科技博物館協調委員會組織章程」，為解決契約爭議，海科館和慶陽雙方各推2名代表人，並經雙方同意協調，選任3名公正人士，共7人組成協調委員會。
柯志恩說，104年8月，大約是吳茂昆汲汲營營於到美國成立師沛恩公司並準備前往大陸申請專利之際，「只能說，當時的吳校長真的好忙呀！只是不知他擔任「協調委員」的身分，究竟是慶陽的2名代表之一，還是雙方共推的3名公正人士之一？」若是前者，可看出吳校長真的「古道熱腸」，對慶富集團愛護有加、居間協調，若是後者，則讓人質疑他是否「假公正」？亦即名為「公正人士」，實際與慶富關係匪淺，對於契約另一造海科館，知不知這位國立大學校長背後的關係，且真的是公正之人呢？
柯志恩表示，吳校長本身是慶富集團相關基金會董事，又擔任慶富子公司的協調委員，如此熱衷於為慶富排難解紛，他本身有無令人高度疑慮的道德問題？究竟是「真出力」還是「假公正」？「口口聲聲以道德責人的吳部長該不該自清一下？」
