那時,彼得進前來,對耶穌說:「主啊,我跑PCR若失敗了,我當重跑幾次呢?到七次可以嗎?」 耶穌說:「我對你說,不是到七次,乃是到七十個七次。」
PCR(聚合酶連鎖反應),是利用懂得複製DNA的「聚合酶」,不斷將指定DNA複製倍化的過程。COVID的PCR檢測,就是以此技術為基礎,加上螢光訊號,讀出DNA相對的含量。
那麼,聚合酶如何知道複製什麼片段?就是靠一對稱為引物(Primer)的短序列片段,一個標註起始序列,一個標註結束聚列。這就像Word的find功能,請你幫我從「so I say I love you」,複製到「笑著去吃苦」。不過,這只是完美情況的講法,因為引物可能會有偏差,把”so I say I f**k you”開始的片段也複製出來,況且,本來就有很多歌有”so I say I love you”,就算不偏差,也會複製錯別的歌。
要知道跑出來的東西是否正確,其中一個方法,是把成品DNA放在大菜糕上,用電場使本帶負電荷的DNA從負極游泳泳到正極。由於不同大小的DNA,游泳速度是不同的,可以藉此看到DNA大小。如果你看到是37字大小的DNA,就知道複製對了姜B的歌。這方法叫電泳(electrophoresis),不過無論中英我們也會說DNA在「跑」。
圖中就是最後一次PCR實驗的電泳結果。這週,我共試了五對Primers,八個溫度設定,兩種聚合酶,總共跑了七個七次,終於跑出一點結果。上面那排,是基於兩篇不同文章,分別發表,聲稱有用的Primers,跑出狗屎一樣的雜訊。(因為誤信他們,在此之前我已經跑了六次。)下面藍色的,才是目標DNA。
人家聲稱是已「最佳化」的PCR,不要信,自己跑一下才知道。要不跑出狗屎也當真,就不太好啦。
(不要問有些Lane為什麼這麼醜,我沒變Hulk用金居福爆橘拳捏爆他已經非常好脾氣了。)
#得罪了PCR小精靈
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🇦🇩 週末安道爾遠足記 |天使的三滴眼淚 - Tristaina高山湖泊群
上週末看氣象預報說安道爾會下雨,我趁還在期限內,趕緊上網把房間免費取消了。我把這件事跟豪斯說,沒想到他一臉不以為然,覺得下雨就下雨,安道爾肯定有漂亮的雨景,說什麼都要我再把房間給訂回來。好吧,看他這麼有遊興,我就又訂了同一處的住宿,但再加上兩客早餐,免得到時下雨還要外出覓食。
由於是週末的小旅行,我們習慣等當天起床後,先把貓咪兩天內可能需要的食物和水準備好,貓砂也清得很乾淨,然後才拿出小行李箱,隨意塞了一些物品進去。一個小時後,我們就已經在往安道爾的高速公路上了。
目前疫情仍是籠罩在歐洲境內,一般來說若要離開西班牙前往其他國家,是需要PCR陰性報告的;不過不知是加泰隆尼亞還是西班牙跟安道爾有協議,所以彼此雙國的居民往返兩地,都不需要提出檢疫證明。
安道爾被稱為雪國,所以很多人以為來這裡只能滑雪,其實大錯特錯。這裡冬天能滑雪,夏天能在庇里牛斯山踏青,像我就是個很喜歡遠足的人,這裡對我來說,是遠離塵囂再好不過的去處了。
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【關於🇦🇩安道爾 Andorra】
根據歷史,西元803年查理曼大帝從穆斯林手中搶回了這個地方,之後經歷了13世紀主教與Foix伯爵間的鬥爭,以及憲法的誕生,在1993年的公投下,這裡成為了一個獨立、民主的議會制公國。尤其在兩次世界大戰都維持中立國的舉動,讓該地的經濟提升不少。
被劃分成七個教區的安道爾的居民不到八萬人口(除了安道爾本地人外,以西班牙人、葡萄牙人和法國人居多),官方語言是加泰隆尼亞語,但是在那裡說西班牙語一點問題也沒有。安道爾幾乎沒有什麼名勝古蹟的它卻也總能吸引許多遊客前來:天氣好時來充滿綠意的山區健行,入冬下雪後則是一處又一處的滑雪勝地;此外,喜歡採購的人也不會錯過安道爾城(Andorra La Vella)佈滿購物場所的大街,商品都是免稅的,很多人都會特地來這裡採買電子產品、菸酒、保養品、精品衣物、各式食品⋯⋯等等。豪斯說他們小時候來這裡連糖都會一起買,離去時也一定要把車子加滿油。
除了健行、滑雪、購物外,這裡還有許多景色優美的小村莊,適合週末時來走走,遠離塵囂。
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我記得我一開始並沒有很喜歡安道爾,覺得那不過是一個採購的地方,但當我更深入認識安道爾且更往北部走時,我便完全讓安道爾的山景給迷住了,動不動就想來這裡爬山。所以當週日出了大太陽,我們趕緊抓住時機,早餐隨意吃吃就辦了退房,然後開車往安道爾的西北邊去。我們的目的地是Tristaina高山湖泊群,也是2020 年10月起被聯合國教科文組織列為生物圈保護區。聽說跨國湖泊群的山,另一邊就是法國了。
從我們市中心的飯店離開,經過好多漂亮的綠野小鎮,拐個彎往左上山,沿途九彎十八拐的,還不時遇到自行車車隊。這條路曾今舉辦過幾次法國自行車賽,請記得:若你開車遇到自行車,絕對不可以直接超車,要等到對面沒來車,且確定能跟自行車維持1.5公尺的寬度距離時,才能超車。
半個多小時後,我們經過由雕塑家 Mauro Staccioli 所設計的直徑4公尺寬的壯觀鋼環 Arcalís 91 紀念碑,再往前,就抵達了Ordino Arcalís的滑雪場了。
夏天滑雪場顯得特別空曠,高山伴著溪水川流不息,滑雪登山纜車高掛在電纜上,隨著風輕微搖擺晃動。我們把車停好,從車裡拿出了登山杖,換上登山鞋,背上裝備還算齊全的後背包,穿件運動外套,我們就開始上山了。
之前上網看說有黃色指標指引你前往,不過我們沒注意到,跟著人群走就是了。
這段山路不難走,沿途老老少少都有,但畢竟在庇里牛斯山嘛,許多高低不平或高或低的起伏,讓人覺得拿登山杖行走會更舒服些。山路不寬,不過遠足者都很有默契,看到對面有人來時,就自動靠邊讓路,頭還會不自主撇往一旁,都是因為疫情讓人仍有所小心。相信我,只要再堅持一點點,莫約40分鐘左右,就能抵達山頭,然後你會驚嘆眼前所看到的Tristaina湖泊群。
最先引入眼簾的是最小但最藍的Primer湖,再往前走,是被碎石和山丘圍繞的Mig湖,最後是呈圓形也是最大的 Més Amunt湖,就位在2878公尺高的山坡上。對了,這裏是屬於典型的高山冰川區,據說夏天很熱的時候還會有人在這裡戲水。
天氣好的時候,很多人會沿著高山的環形路線來場湖區健行,兩千三百多公尺高的海拔,距離約4.4公里,需三個小時左右才能走完。不過我們擔心多變的氣候,以及糧食也不夠,所以只在山上待了一個多小時,當發現另一邊的烏雲正朝這裡慢慢飄過來時,我們知道該下山了。
我很難形容當下自己的感受,小小一個人置身在壯大的庇里牛斯山群裡,幾百年的冰川搭配高山景觀,遼闊的牧場與層林覆蓋的山谷,那種心曠神怡之感,在這裡一再上演。
有機會,來安道爾健行吧。
ℹ️ 分享我們這次的旅遊資訊:
📱西班牙手機到安道爾無法免費漫遊,所以進入之前要記得開飛航模式,建議先下載Google的離線地圖。
🏨 Hotel NH Andorra La Vella: Av. Dr. Mitjavila, 1, Andorra la Vella, Andorra(飯店提供付費室內私人停車場)
🛍️ 購物區: Avenida Meritxell, Fener Boulevard 和Vivand.
🍴Marisqueria Don Denis: c/ isabel sandy 3, Escaldes-Engordany, Andorr
🍴Molí dels Fanals: Av. de les Comes, 3, AD400 Sispony, Andorra
🍴 A Casa Canut Hotel Gastronomic: 107 Av Carlemany, Escaldes-Engordany Andorra
🍴 Restaurant 120: Av. Meritxell, 120, Andorra la Vella, Andorra
🅿️ Estación de esquí Ordino Arcalís滑雪場的停車場: Ctra. d'Arcalís, Ordino, Andorra
pcr primer 在 北歐心科學 NordicHearts Facebook 的最佳解答
《qPCR檢測的私隱問題》
PCR是複製DNA的方法,過程需要稱為「引物」(primer)的物質。簡單說,引物是一個引子,包含了指定序列,你可以當是Microsoft Word裡的Find功能,一般是有一對,簡稱F和R,分別代表從何開始,從何結束。PCR,就是由起始引子相應的序列,複製到結束引子相應的序列。打個比方,起始引子是「我們在天上的父」,結束引子是「直到永遠,阿門。」,PCR就會把整段《主禱文》複製出來。
檢測武漢病毒的qPCR,一般進行兩到三組,各有一對primer,分別對應武漢病毒的不同基因。理論上,如果這Find功能找到了武漢病毒的基因,就會將其複製倍化,過程發出螢光訊號。觀察螢光,就可以估計有否倍化。而為了確保樣本有人類基因以及PCR過程順利,以減低假陰性機會,最理想是同時用對應人類基因的primer,因為理論上如果樣本沒問題,一定會有人類基因。(這又稱作內部對照組/internal control)
實驗設計上,這是非常合理的。然而從私隱層面上,政府或公司有權倍化人類的基因嗎?本來的primer設計,是從你的電腦文件中複製《主禱文》,但只要將primer換成「全澳門最大」和「上線啦」,就可以複製出《賭場廣告》,便知道你有沒有看AV了。誰授權政府,可以用這primer,不可以用那primer呢?
用特定primer組合來找出器官匹配度相關資訊,這種隨便想都能想到的方法,當然有人做了,而且廿幾年前已經做了。這說明單單用檢測武漢病毒同樣的檢測平台,足以找出你各樣基因資訊。
當然,現在有更多更先進的方法,不用靠PCR。我們系統性地交出人類樣本,中間有什麼人處理,拿來做過什麼實驗,更無人知曉。
然而,政府並無公開他們用什麼primer組合,什麼實驗設計,什麼準則判定陽性,更遑論樣本的處理過程(之前就發生了公司交叉感染樣本的情況。)。另邊廂,我們也從不討論這技術必然會引伸的私隱問題。
很多本業就是做人類基因定序的公司,得了這麼大量的人類樣本,難道不會偷偷看一眼?難道陳冠希叫你幫他修電腦,你不會看一眼?
(用PCR找出你器官匹配度的方法:
https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-62703-493-7_8)
pcr primer 在 72℃左右進行DNA聚合反應,會從引子的3'端開始延長做出產物 ... 的推薦與評價
最後幾個主題把它結束其實這邊大部分是抄講義的啦就輕鬆看,會考的不出這些,順便分享幾個口訣 PCR (Polymerase Chain Reaction) M要進行PCR時需要: 1⃣當 ... ... <看更多>